Hội Pháp Sư: Nhiệm Vụ 100 Năm kể về một năm sau khi đánh bại Zeref và Acnologia, Natsu cùng hội Fairy Tail lại tiếp tục lên đường phiêu lưu. Lần này, họ nhận lời thực hiện Nhiệm Vụ Trăm Năm, một thử thách bí ẩn đã được lưu truyền từ lâu trong hội. Hành trình đưa họ đến với những vùng đất mới, nhiều kẻ thù hùng mạnh và vô vàn bí mật chưa từng được tiết lộ. Natsu và các bạn sẽ phải chiến đấu hết mình để hoàn thành nhiệm vụ, đồng thời bảo vệ thế giới khỏi những thế lực tà ác.